在计算化学中，Gaussian是一款十分常用的软件，然而，笔者之前在本地Linux下使用它时，却一直出现段错误的报错提示，无法使用。
由于段错误一般是程序设计缺陷导致的，笔者之前一直以为Gaussian的Linux版程序有问题。
Gaussian的文件架构设计很容易让人联想到这点：Gaussian在Linux下的二进制文件具有.exe的后缀名，但是却真的是elf格式；都2023年了Gaussian的Linux版的shell脚本居然仍然基于csh；Linux版软件的文件命名居然叫bsd；这个软件整体就给人一种很不靠谱的感觉。因此，笔者长期以来均没有在本地的Linux下运行过Gaussian。然而，在一次社团聚会中，学长告诉笔者Gaussian的段错误是自己raise的，实际上很有可能是环境没有配置正确，或者输入文件有问题。笔者这才开始重新在本地的Linux下配置Gaussian。
配置
Gaussian的配置教程在网上并不少，但是大多都是面向不懂Linux的小白的，而且也大多运行在超算上，重点在于能用，而并没有在乎本地配置的整洁性。
而笔者长期使用Linux系统，不能简单地像一般的教程那样写.bashrc，以免影响正常使用。
笔者选择了在Gaussian软件目录下创建一个配置文件，命名为1-gaussian.profile：
export g16root=/home/wszqkzqk/Downloads # 按需替换为Gaussian文件夹实际所在位置
export GAUSS_SCRDIR=/var/tmp # 存放临时文件的位置
source $g16root/g16/bsd/g16.profile # 加载Gaussian自己的环境配置文件
由于笔者使用的fish不兼容POSIX的shell脚本风格，在每次Gaussian相关的软件时，需要先运行zsh或者bash，再加载1-gaussian.profile，然后再运行Gaussian的二进制文件：
source /home/wszqkzqk/Downloads/g16/1-gaussian.profile
/home/wszqkzqk/Downloads/g16/g16 <input.com> output.log
报错原因
笔者的Gaussian在此前报错的原因让人哭笑不得😂。笔者之前曾在Windows下使用Gaussian，在其中指定的chk文件的输出路径是Windows下的路径，而在Linux下，这个路径是不存在的，因此Gaussian在读取这个文件时，就会报错。
为了跨平台的兼容性，笔者直接将chk文件的输出指定在当前目录下，这样就不会出现路径问题了。
chk文件的坑
Gaussian的chk文件是一个平台相关的二进制文件。很多人可能知道在超算（运行Linux）上输出的chk文件在Windows下无法查看，同理，在Windows下输出的chk文件在Linux下也无法查看。同时，Linux下的Gaussian也并没有包含能够转化Windows下生成的chk文件的工具，因此如果有在Linux下查看Windows输出chk文件的需求，需要预先在Windows下将文件转化为fchk。
不过，由于都是Linux系统，本地Linux下的Gaussian也可以直接读取超算生成的chk文件，而不需要转化为fchk。
评价
虽然大多数需要用Gaussian计算的人都不会在本地Linux下使用Gaussian，但笔者认为这还是有很多优势：
- 北京大学正版软件平台仅提供Linux版下载
- 显然是为了方便超算的使用
- 但本地Linux也可以直接使用
- 有时候本地使用Gaussian较超算方便灵活
- 北京大学正版软件平台提供的Linux版Gaussian是最新的且有AVX2指令集支持
- 一般的Windows泄漏版没有支持AVX2指令集
- Linux版显著更快
- 主要使用Linux的用户不用重启到Windows下使用Gaussian
